Изменения в техническом регламенте и переход на 800-кубовые двигатели MotoGP поставили точку в разработках Yamaha M1. Объем мотора уменьшился на 20%, таким образом в FIM намеревались сбить растущие скорости гранприйных прототипов. Как показала практика, гонку вооружений это не остановило. Первый сезон в новом формате прошел в постоянной борьбе новобранца Marlboro Ducati Кейси Стоунера с Росси, и Стоунер в итоге одержал верх. Дело в том, что в Ducati заранее подготовились к новому чемпионату. Их прототип был представлен еще в июне 2006 года, тогда как Yamaha и Honda показали свои разработки только осенью, на официальных тестах. Honda пришлось дорабатывать мотоцикл еще два года, Yamaha удалось решить множество проблем уже на зимних тестах 2007.
К концу 2007 года, у Yamaha вновь был конкурентоспособный прототип, который за зиму команда Росси-Бёржесса довела до совершенства. Росси выиграл очередной чемпионский титул, а его новый напарник Хорхе Лоренцо - титул "Новичка года". Начиная с Гран-При Португалии 2008, начинается противостояние Росси-Лоренцо за лидерство в Yamaha. Фактически, оно завершилось годом спустя, после подписания Yamaha нового контракта с Лоренцо: испанец получил гарантии полного технического обеспечения и конфигурацию мотоцикла "как у Росси". Тем самым, завод дал понять, что эксклюзивные права Валентино на M1 аннулированы. Валентино, конечно же, не был готов к такому повороту событий. Став чемпионом мира в 7-й раз (в 9-й с начала карьеры в Призах), он все же решил уйти из Yamaha. Контракт с заводской командой завершался в 2010, который еще нужно было отработать по полной (а иначе Валентино не умел).
Возможно, Росси засунул бы за пояс восьмой титул, если бы не зубодробительное крушение на Гран-При Италии в Муджелло в июне 2010. Именно там Валентино впервые за свою карьеру получил травму, заставившую его не выйти на старт - сломал правое бедро. По предварительным оценкам, Росси мог провести в гипсе от 3 до 5 месяцев. Вместо этого, он вернулся в гонки спустя 90 дней! Через четыре месяца после катастрофы он вновь выиграл Гран-При.
За семь лет, что Валентино прожил бок о бок с Yamaha, он вышел на старт 116 раз, 117-ым станет Гран-При Валенсии. За этот период Росси выиграл 46 гонок - его счастливое число, его номер!
"Ну, что же, мы снова здесь, готовимся к моей последней гонке вместе с Yamaha, - начал свою речь Доктор на пресс-конференции в Валенсии, - Это будет очень эмоциональный уикенд для всех нас! На самом деле, столько лет прошло - очень много - семь! Но как-будто всего полтора года. Время пролетело незаметно, потому что я наслаждался работой с Yamaha, особенно, когда мы достигали высоких результатов. Конечно же, я постараюсь выиграть финальную гонку сезона, ради наших давних партнерских отношений, которые были полны прекрасных моментов."